在土壤中生活的生物群的總稱(chēng)。亦稱(chēng)土居生物（edaphone）、土壤動(dòng)物（也稱(chēng)地下動(dòng)物）。菌類(lèi)、地表藻類(lèi)加上高等植物的根部等，都是該群落的組成要素。在陸上群落的營(yíng)養(yǎng)動(dòng)態(tài)中，土壤生物群落通過(guò)腐食食物鏈承擔(dān)著植物死體、動(dòng)物排泄物、動(dòng)物尸體等有機(jī)物的分解，還原成無(wú)機(jī)物的大部分工作。在自然土壤中，絲狀菌的作用量，較之細(xì)菌占有壓倒的優(yōu)勢(shì)。土壤動(dòng)物通過(guò)排出的糞塊，形成土壤團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，改善通氣性和保水性，并可使菌體和孢子在地下擴(kuò)散等等，從而促進(jìn)微生物的活動(dòng)。在日本的自然土壤中，大型土壤動(dòng)物（蚯蚓類(lèi)、馬陸類(lèi)，蜘蛛類(lèi)、蜈蚣類(lèi)、甲殼類(lèi)）的數(shù)量每1平方米為102，雙翅目幼蟲(chóng)為103，姬蚓類(lèi)、蜱螨類(lèi)、跳蟲(chóng)類(lèi)各為104，自由生活的線蟲(chóng)類(lèi)則為105—106，細(xì)菌類(lèi)每克表層風(fēng)干土達(dá)106—107，菌類(lèi)則為105（菌絲總長(zhǎng)達(dá)1—6公里）的量級(jí)。整個(gè)土壤生物群落的呼吸量稱(chēng)為土壤呼吸，是土壤生物活性的指標(biāo)。